במהלך פעולת ההגנה הקתודית, הגורמים העיקריים לדליפת צנרת הם כדלקמן:
① בנייה לא נכונה, צינור צולב אינו סטנדרטי. כאשר צינור מוגן חוצה צינור לא מוגן, המרווח בין שני הצינורות אינו עומד בדרישות עקב בנייה לא נכונה. לאחר הקבורה לתקופה מסוימת, שכבת האדמה המילוי חוזרת משתנה, ושני הצינורות חופפים זה לזה כדי לשבור את שכבת האנטי קורוזיה. מגע המתכת של שני הצינורות יוצר נקודת דליפה.
② כשל או דליפה של אוגן בידוד. לנוחות הניהול, תחנת המיגון הקתודית נבנית לרוב יחד עם התחנה, וצינור המיגון מצויד באוגנים מבודדים פנימה ומחוץ לתחנה. כאשר המדיום המעביר צינור מכיל זיהומים מוליכים, דליפה לתחנה ולצינור הלא מוגן. אם איכות אוגן הבידוד אינה טובה, לאחר שחלקי הבידוד ייפגעו במהלך השימוש, צינור ההגנה והצינור שאינו מגן יחוברו חשמלית, וכתוצאה מכך תקלת דליפה.
③ דליפה בנקודת הפגיעה של השכבה האנטי קורוזיבית. בשלב מאוחר יותר של פעולת הצינור, הגדלת נקודת הפגיעה תגרום גם לדליפה בצנרת.